Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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