Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prima1Q810F0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prima1Q810F0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms