Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms