Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms