Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rims3Q80U57 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rims3Q80U57 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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