Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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