Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.3 ms