Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atp8b3Q6UQ17 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atp8b3Q6UQ17 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atp8b3Q6UQ17 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atp8b3Q6UQ17 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atp8b3Q6UQ17 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atp8b3Q6UQ17 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atp8b3Q6UQ17 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atp8b3Q6UQ17 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms