Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RgmaQ6PCX7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RgmaQ6PCX7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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