Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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