Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Msl2Q69ZF8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Msl2Q69ZF8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Msl2Q69ZF8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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