Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sbno1Q689Z5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sbno1Q689Z5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sbno1Q689Z5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sbno1Q689Z5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms