Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms