Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sox19Q62249 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sox19Q62249 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sox19Q62249 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sox19Q62249 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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