Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms