Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms