Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms