Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms