Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms