Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms