Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Dnah12Q3V0Q1 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Dnah12Q3V0Q1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Dnah12Q3V0Q1 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Dnah12Q3V0Q1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Dnah12Q3V0Q1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Dnah12Q3V0Q1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Dnah12Q3V0Q1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Dnah12Q3V0Q1 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms