Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms