Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp48Q3V0C5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Usp48Q3V0C5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Usp48Q3V0C5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Usp48Q3V0C5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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