Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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