Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf224Q3UIW8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms