Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pid1Q3UBG2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms