Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cops9Q3U898 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms