Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms