Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U6N9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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