Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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