Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms