Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms