Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms