Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms