Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms