Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms