Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Itgb8Q0VBD0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Itgb8Q0VBD0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Itgb8Q0VBD0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Itgb8Q0VBD0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Itgb8Q0VBD0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Itgb8Q0VBD0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Itgb8Q0VBD0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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