Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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Ttc21bQ0HA38 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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