Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MitfQ08874 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms