Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms