Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Cnn1Q08091 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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