Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms