Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms