Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms