Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms