Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms