Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms