Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms