Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms