Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Irx1P81068 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Irx1P81068 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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